《碇真嗣育成计划》是一款以《新世纪福音战士》为背景的养成类游戏，玩家将扮演NERV指挥官，通过日常安排、战斗训练和心理辅导培养碇真嗣。游戏融合策略与剧情选择，需平衡真嗣的能力值（如同步率、精神状况），同时处理与其他角色（如绫波丽、明日香）的关系。不同选择会触发原作经典场景或原创结局，影响真嗣的成长方向——可能成为坚强驾驶员或崩溃逃避。游戏以独特的“压力系统”还原角色心理挣扎，并包含多周目要素，通过解锁隐藏事件探索EVA世界的更多可能性。